Den nordlige del af søen ligger i Silkeborg Kommune, og resten af søen ligger i Skanderborg Kommune. I Silkeborg Kommune kan der bades fra det offentlige areal Ludvigslyst ved Svejbæk, hvor der findes en anløbsbro til turbådene. Desuden føres tilsyn med vandkvaliteten ved Laven i østenden af søen, dette er dog kun en kontrolstation og ikke et badested.
Algevækst
Julsø modtager store mængder næringssalte med vandet i Gudenåen. Derfor forekommer der de fleste år en betydelig algevækst i søen, nogle år med forekomst af blågrønalger. Algevækst medfører forøgelse af søvandets pH, og er væksten særlig kraftig, kan pH blive så høj, at badende kan opleve hudgener. Desuden udskiller nogle arter af blågrønalger giftstoffer, der i værste fald kan være dødelige. Hvis vandet er meget uklart og grønligt, bør man derfor ikke bade i søen.
God hygiejnisk kvalitet
Silkeborg Kommune udfører hvert år i badesæsonen kontrol med badevandskvaliteten ved Ludvigslyst og Laven Stationsby. Analyserne af de udtagne vandprøver viser, at indholdet af fækale bakterier er lavt som tegn på, at den hygiejniske kvalitet af badevandet er god.